Chcete porozumět bioinformatickým pipeline z pohledu uživatele a zorientovat se v používaných softwarových nástrojích?
Tento seminář je určen právě vám.

KDY? 15. 5. 2025
Seminář se uskuteční v sídle naší společnosti na adrese Na Jetelce 69/2, Praha 9 – Vysočany, 190 00.
V případě zájmu o účast prosíme o vyplnění registračního formuláře.
Registrační formulář ZDE
Seminář bude probíhat v čase 9:00–17:00 hodin ve skupině maximálně 12 účastníků.
Program semináře:
- Příprava a kontrola designu prób pro NGS
 Přehled pokrytí oblastí genomu próbami
 Práce s designy (BED soubory) v UCSC Genome Browseru
- Germinální a somatická analýza dat
 FASTQ soubory + kontrola kvality
 Alignment – BAM soubory + QC
 Variant calling – VCF soubory
 Rozdíly mezi různými pipeline
 Detekce fúzí a strukturních variant
- Terciární analýza dat (anotace)
 Databáze a in silico predikční nástroje
- Porovnání softwarů pro analýzu dat a validaci výsledků
 Zavedené pipeline a jejich výstupy
 ACMG klasifikace, filtrování variant
 „Podpůrné“ nástroje
 Přehled komerčních softwarových řešení: VarSome, SeqOne, GeneSystems
Cena semináře je 4 500 Kč bez DPH.
Fakturace proběhne po skončení kurzu, fakturu zašleme na e-mail uvedený v přihlášce.
V případě jakýchkoliv dotazů se neváhejte obrátit na Marii Šurinovou: maria.surinova@altium.net tel.č: 605 791 379
Těšíme se na setkání!
 
    